De ziekenhuisbacterie is een verzamelnaam van bacteriën die imuun zijn voor verschillende soorten antibiotica en daardoor verwekkers zijn van veel voorkomende ziekenhuisinfecties. Een ziekenhuisbacterie komt niet alleen in het ziekenhuis voor, maar ook in andere omgevingen. Bekende ziekenhuisbacteriën zijn Acinetobacter Baumannii, MRSA en MRSE. Patiënten in het ziekenhuis hebben vaak een verzwakt afweersysteem en zijn extra kwetsbaar voor infecties met een ziekenhuisbacterie.